De darmflora speelt een belangrijke rol voor de menselijke gezondheid. In de afgelopen tien jaar heeft de virale fractie van de darmflora, die in wezen uit fagen bestaat die bacteri\u00ebn infecteren, steeds meer aan belang gewonnen. Parallel aan de ontwikkeling van de virale metagenomics werden talrijke nieuwe fagenfamilies ontdekt. Sinds de ontdekking van de intestinale fagen door d’H\u00e9relle in 1917 is ons begrip van de invloed van de fagen op de structuur van de darmflora echter nog steeds gering. Veranderingen in de samenstelling van de virusgemeenschap werden bij verschillende ziekten waargenomen. Of deze veranderingen echter een directe betrokkenheid van fagen bij het ontstaan van ziekten weerspiegelen of eenvoudigweg te wijten zijn aan veranderingen in de bacteri\u00eble samenstelling, is momenteel niet bekend. Hier geven wij een overzicht van de huidige stand van kennis over de intestinale fagen, hun identiteit, hun levenswijze en hun mogelijke effecten op de darmflora. Daarnaast verzamelen wij de belangrijkste gegevens over de interacties van de fagen met het immuunsysteem, waarbij wij een bijzondere nadruk leggen op de nieuwste inzichten. <\/p>\n
Conclusies
\nTijdens het afgelopen decennium heeft de virale metagenomics de taxonomische samenstelling en dynamiek van de virale component van de darmflora opgehelderd. De diepe sequencing en nieuwe assemblagemethoden hebben de beschrijving van volledig nieuwe fagen mogelijk gemaakt. Deze benaderingen hebben vooral aangetoond dat de samenstelling van het viroom zeer variabel is, waarbij slechts een klein deel van de fagen tussen individuen wordt gedeeld. Het is niet verrassend dat de meest voorkomende virussen Bacteroides- en Clostridiales-soorten infecteren, die dominant zijn in de microbiota. Parallel daaraan maakten experimenten met dieren met een vereenvoudigde microbiota de verkenning van fagen-bacteri\u00ebn-antagonistische interacties in de darm mogelijk en hebben variabele resultaten aan het licht gebracht. Bij sommige fagen-bacteri\u00ebn-paren beschermt het darmmilieu de bacteri\u00ebn op de een of andere manier, en wordt slechts een klein deel van de genetisch kwetsbare bacteri\u00ebn door hun specifieke fagen gedood. In andere gevallen wordt het grootste deel van de fagengevoelige bacteriepopulatie binnen enkele dagen vervangen door resistente mutanten, wat wijst op een zeer effici\u00ebnte fageninfectie. Daarom blijft het moeilijk te voorspellen welk resultaat zal overheersen in de complexe natuurlijke microbiota. Sporen van fagenpredatie kunnen worden gevonden in de genomen van darmbacteri\u00ebn, maar deze sporen zouden kunnen wijzen op een geringe fagen-ge\u00efnduceerde mortaliteit. Een geringe fagenpredatie zou niettemin cruciaal kunnen zijn voor het vormgeven van de samenstelling en functionaliteit van de microbiota, door de bacteri\u00eble evolutie te be\u00efnvloeden via horizontale genoverdracht, maar ook door het bevorderen van de bacteri\u00eble diversiteit. Bij kortere ecologische tijdschalen is de invloed van de fagen minder goed vastgesteld. Met name de rol van de fagen bij de dysbioses die verschillende pathologische toestanden begeleiden, is nog niet voldoende gedefinieerd. Dankzij recente vooruitgang bij het bepalen van fagen-bacteri\u00ebn-paren kunnen nu longitudinale studies worden uitgevoerd om mogelijke relaties tussen temporele verschuivingen bij bacteri\u00ebn en de bijbehorende fagen te identificeren en om af te bakenen of fagen bijdragen aan dysbiose en ziekte of integendeel door het behoud van de bacteri\u00eble diversiteit kunnen bijdragen aan het behoud van de stabiliteit van de microbiota. <\/p>\n
Verdere studies zijn ook vereist om mogelijke directe wisselwerkingen van fagen met immuuncellen aan te tonen en om te defini\u00ebren of en hoe dergelijke directe effecten de samenstelling van de bacteri\u00eble microbiota veranderen en de gezondheid of ziekte van de gastheer kunnen be\u00efnvloeden. De definitie van de mechanismen die de uitkomst van de fagen-bacteri\u00ebn-interacties in de darm bepalen, is bijzonder belangrijk voor het perspectief van de fagentherapie, die, om Br\u00fcssow te citeren,125 “zonder twijfel een interessante benadering is voor het probleem van antibioticaresistentie en versterkt onderzoek verdient om uit de vruchteloze confrontatie tussen het enthousiasme uit het Oosten en de aanhoudende westerse scepsis te komen”. <\/p>\n
Vertaling van de bron: https:\/\/www.nature.com\/articles\/s41385-019-0250-5<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"
De darmflora speelt een belangrijke rol voor de menselijke gezondheid. In de afgelopen tien jaar heeft de virale fractie van de darmflora, die in wezen uit fagen bestaat die bacteri\u00ebn infecteren, steeds meer aan belang gewonnen. Parallel aan de ontwikkeling van de virale metagenomics werden talrijke nieuwe fagenfamilies ontdekt. Sinds de ontdekking van de intestinale […]<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":8068,"comment_status":"closed","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_bbp_topic_count":0,"_bbp_reply_count":0,"_bbp_total_topic_count":0,"_bbp_total_reply_count":0,"_bbp_voice_count":0,"_bbp_anonymous_reply_count":0,"_bbp_topic_count_hidden":0,"_bbp_reply_count_hidden":0,"_bbp_forum_subforum_count":0,"_jetpack_newsletter_access":"","_jetpack_dont_email_post_to_subs":false,"_jetpack_newsletter_tier_id":0,"_jetpack_memberships_contains_paywalled_content":false,"_jetpack_memberships_contains_paid_content":false,"footnotes":""},"categories":[],"tags":[],"class_list":["post-8300","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry"],"jetpack_featured_media_url":"https:\/\/i0.wp.com\/www.phage.help\/wp-content\/uploads\/2019\/06\/belly-3186730_960_720.jpg?fit=480%2C321&ssl=1","jetpack_shortlink":"https:\/\/wp.me\/pazElU-29S","jetpack_sharing_enabled":true,"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.phage.help\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/8300","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.phage.help\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.phage.help\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.phage.help\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.phage.help\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=8300"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.phage.help\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/8300\/revisions"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.phage.help\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/media\/8068"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.phage.help\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=8300"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.phage.help\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=8300"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.phage.help\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=8300"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}