Cómo los depredadores influyen en nuestra flora intestinal: los bacteriófagos

El microbioma intestinal es un ecosistema complejo e interconectado de especies. Y, como en cualquier ecosistema, algunos organismos son depredadores y otros, presas. Un nuevo estudio realizado por investigadores del Brigham and Women’s Hospital y del Wyss Institute examina los efectos de los bacteriófagos, virus que infectan y matan bacterias. Concluyen que los fagos pueden tener una influencia profunda en la dinámica del microbioma intestinal, al afectar no solo directamente a determinadas especies, sino también al provocar un efecto en cascada sobre otras. Los fagos también pueden afectar a su huésped humano al modular metabolitos, incluidas sustancias químicas que se encuentran en el cerebro. El equipo, del que forman parte el primer autor Bryan Hsu y la autora principal de correspondencia Pamela Silver, del Wyss Institute, así como la Dra. Lynn Bry, del Brigham and Director del Massachusetts Host-Microbiome Center, Cell Host & Microbe.

«Uno de los principales intereses de mi laboratorio es comprender los cambios en la dinámica del microbioma intestinal. Los bacteriófagos son una parte importante del microbioma, pero aún no se han estudiado mucho», dijo el Dr. Ph.D., MPH, codirector del Massachusetts Host-Microbiome Center y jefe de la División de Patología Computacional del Departamento de Patología del Brigham. «Algunas personas investigan la terapia con fagos y utilizan fagos para matar microbios, pero los fagos también se encuentran de forma natural en el intestino y coexisten con el resto del ecosistema. Queríamos averiguar qué hacen allí».

Para responder a esta pregunta, el equipo colonizó los intestinos de ratones con un conjunto definido de especies bacterianas humanas y, a continuación, añadió fagos para seguir el crecimiento de cada microbio. Mediante secuenciación de alto rendimiento y análisis informáticos, el equipo descubrió que los fagos causaban la disminución de las especies de las que se alimentaban, como era de esperar, pero con un efecto dominó sobre el resto del ecosistema, incluidas proliferaciones de especies no objetivo.

Además de investigar los efectos sobre los microbios, el equipo también estudió los efectos sobre el metaboloma: sustancias químicas que pueden proceder tanto del huésped como de las bacterias presentes. Descubrieron que, al modular el microbioma con fagos, podían observar cambios específicos en el metaboloma, incluidos cambios en los niveles de neurotransmisores y de ácidos biliares.

«Este hallazgo me fascina para seguir investigándolo y plantea preguntas importantes: ¿Podemos utilizar fagos para modular estas actividades? ¿Podría ser una intervención en enfermedades como la depresión, en las que se desea modificar los niveles de neurotransmisores?», dijo Gerber. «Aunque no se utilicen como un terapéutico directo, nuestro estudio sugiere que los fagos pueden ser una buena herramienta para comprender los posibles efectos de otros terapéuticos que modifican el microbioma».

Gerber y sus colegas están especialmente interesados en estudiar la interfaz entre los fagos y la desnutrición en los países en desarrollo, ya que la desnutrición puede tener efectos profundos en el metaboloma y el microbioma.

«Esperamos que nuestro trabajo proporcione un marco para futuras investigaciones que examinen la interacción entre fagos, microbiota y la salud y la enfermedad del huésped», dijo Gerber.

Fuente: https://phys.org/news/2019-06-phage-bacteria-predators-gut-microbiome.amp

Bryan B. Hsu et al, Modulación dinámica de la microbiota y el metaboloma intestinales por bacteriófagos en un modelo murino, Cell Host & Microbe (2019)

Los antibióticos contaminan ríos en todo el mundo

El equipo de investigación buscó residuos de 14 antibióticos comúnmente recetados en ríos de 72 países diferentes. Se encontraron antibióticos en casi dos tercios de las muestras.

Tres fármacos destacan

Se midieron niveles peligrosos de contaminación con especial frecuencia en Asia y África. Los investigadores determinaron el peor valor en un río de Bangladés: la concentración del medicamento metronidazol, utilizado para infecciones bacterianas y parasitarias, superó el valor de seguridad en trescientas veces. Pero también en Kenia, Ghana, Pakistán y Nigeria, los residuos medidos son alarmantes.

El principio activo más extendido fue el trimetoprim, que se receta, por ejemplo, para infecciones de vejiga. El antibiótico se detectó en el 43 por ciento de los lugares examinados. El antibiótico que con mayor frecuencia superó el valor límite fue la ciprofloxacina, utilizada, por ejemplo, para ciertas infecciones respiratorias o del tracto genital.

Peligro de gérmenes resistentes

Ya en abril, la ONU advirtió sobre el peligro de la resistencia microbiana y habló de una «crisis global». Según el informe, unas 700.000 personas ya mueren hoy a causa de enfermedades resistentes a los medicamentos. Para 2050, esta cifra podría aumentar a diez millones de muertes al año, si se considera el peor escenario y si no se hace nada al respecto.

Alistair Boxall también afirma que es absolutamente necesario invertir en infraestructuras adecuadas para el tratamiento de aguas residuales y limpiar los ríos ya contaminados: «Resolver el problema será una tarea gigantesca».

 

Fuente: https://www.srf.ch/article/17242869/amp

Los fagos salvaron la vida de mi hija: terapia con fagos

Un cóctel de fagos salvó la vida de una adolescente que tenía una infección mortal y aparentemente intratable.

El cuerpo de Isabelle fue atacado por bacterias y se le dio una probabilidad de supervivencia inferior al 1%.

Sin embargo, los médicos del Great Ormond Street Hospital probaron una terapia con fagos no verificada, en la que se utilizan virus para infectar y matar bacterias.

La terapia con fagos fue un éxito total. Isabelle ahora está aprendiendo a conducir y estudia para su bachillerato.

Los expertos dijeron que el caso era enormemente emocionante y mostraba el potencial para tratar otras infecciones peligrosas con fagos.

 

La historia completa en:
https://translate.google.com/translate?hl=de&sl=it&tl=de&u=https%3A%2F%2Fwww.bbc.com%2Fnews%2Fhealth-48199915

Terapia con fagos: ¿Qué factores determinan la biodisponibilidad de los fagos?

Los bacteriófagos ya no son virus olvidados: científicos y profesionales desean comprender la farmacocinética de los fagos en animales y humanos e investigar los bacteriófagos como agentes terapéuticos, nanotransportadores o componentes del microbioma. Esta revisión ofrece una visión general exhaustiva de los factores que determinan la circulación, la penetración y la eliminación de los fagos, y que determinan la aplicabilidad de los fagos en medicina. Utiliza datos experimentales recopilados hasta ahora por la comunidad de fagos (PubMed 1924-2016, incluidos informes en idiomas distintos del inglés) y combina elementos de una revisión crítica y sistemática.

Este estudio aborda la capacidad del fago para penetrar en un sistema a través de diversas vías de administración, cómo (y si) el fago puede acceder a diferentes tejidos y órganos, y qué mecanismos determinan en última instancia el curso de la eliminación del fago. Se aplicó el método de revisión sistemática para

(i) analizar la supervivencia de los fagos en el intestino (tránsito intestinal) y

(ii) la capacidad del fago para penetrar en el sistema de mamíferos a través de múltiples vías de administración.

Los aspectos que aún no están cubiertos por un número suficiente de informes para el análisis matemático, así como los mecanismos subyacentes a las tendencias, se discuten en forma de revisión crítica.

A pesar de la extraordinaria diversidad de bacteriófagos y posibles aplicaciones de fagos, el análisis mostró que la morfología del fago, la especificidad del fago, la dosis de fago, la presencia de bacterias sensibles o las características de los individuos tratados (edad, taxonomía) pueden influir en la biodisponibilidad de los fagos en animales y humanos. Una vez que los fagos penetran con éxito en el organismo, alcanzan la mayoría de los órganos, incluido el sistema nervioso central. Los bacteriófagos son eliminados principalmente por el sistema inmunitario: la inmunidad innata elimina los fagos incluso cuando aún no se ha desarrollado una respuesta específica a los bacteriófagos.

Más información en la fuente:
https://translate.google.com/translate?hl=de&sl=en&tl=de&u=https%3A%2F%2Fonlinelibrary.wiley.com%2Fdoi%2Ffull%2F10.1002%2Fmed.21572

Bacterias asesinas: Aumenta el número de muertes por resistencia a los antibióticos

Tienen nombres tan apetitosos como Escherichia coli, Staphylococcus aureus, Enterococcus faecalis y Enterococcus faecium, Streptococcus pneumoniac o Acinetobacter spp.

Y son asesinos modernos que están acabando con cada vez más personas. Tienen éxito porque son resistentes a los antibióticos.

Solo en la UE y en los estados de la Comunidad Económica Europea, el número de muertes atribuibles a la resistencia a los antibióticos de las bacterias más letales ha aumentado de 11.114 muertes en 2007 a 27.249 muertes basándose en 10 patógenos microbacterianos (para fines de comparabilidad con 2007) o 33.110 muertes basándose en 16 patógenos microbacterianos en 2015. Este resultado se encuentra en un nuevo estudio de Alessandro Cassini y 16 coautores, un verdadero acontecimiento autoral.

Los autores han calculado la mortalidad y los años de vida perdidos por muerte prematura atribuibles a bacterias resistentes a ciertos antibióticos, basándose en datos del proyecto europeo «EARS» – European Antimicrobial Resistance Surveillance Network. Esto último es un juego estadístico con demasiadas incertidumbres como para poder interpretarlo de manera significativa. Las muertes, en cambio, son cadáveres tangibles, por lo que nos referimos a los resultados del colectivo de autores sobre la mortalidad debido a la resistencia a los antibióticos.

  • Los autores han calculado 671.689 infecciones para el año 2015.
  • 33.110 infecciones tuvieron un desenlace fatal.
  • La tasa de mortalidad por infección es, por tanto, del 4,9%.
  • El 63,5% de las infecciones se produjeron en un hospital o en otra institución cuyo objetivo es la recuperación.
  • El 72,4% de los 33.110 fallecidos (23.976) sucumbieron en hospitales a las consecuencias de una infección que habían contraído en el propio hospital.

Fuente: https://sciencefiles.org/2019/04/07/killer-bakterien-zahl-der-toten-durch-antibiotika-resistenz-steigt/

Los virus pueden ayudar a tratar Pseudomonas aeruginosa en la fibrosis quística

Los investigadores determinaron mediante un modelo de pez de agua dulce para la fibrosis quística (FQ) que una combinación de bacteriófagos y antibióticos es eficaz contra la enfermedad.

La neumonía causada por la bacteria Pseudomonas aeruginosa es la principal causa de muerte en pacientes con FQ. Dado que los antibióticos actuales no protegen contra bacterias difíciles de tratar, existe una gran necesidad de terapias alternativas.

En un estudio publicado recientemente, los investigadores describieron un cóctel de bacteriófagos (virus que infectan bacterias de forma natural) que resultó eficaz contra P. aeruginosa en dos modelos animales de infección aguda. Ahora, los investigadores probaron cómo funcionaría un enfoque similar en un modelo de pez cebra de agua dulce de FQ. Aunque un modelo animal sin pulmones puede no ser el más adecuado para probar un tratamiento contra la FQ, los peces cebra modificados genéticamente para carecer del gen CFTR (el gen defectuoso en la FQ) presentan una manifestación de la enfermedad muy similar a la humana. La secuencia genética de CFTR es bastante similar entre especies.

En el estudio, los investigadores infectaron embriones de pez cebra y verificaron que las bacterias marcadas con fluorescencia se propagaban rápidamente por todo el embrión. La infección causó la muerte de al menos el 50% de los embriones 20 horas después de la infección. Como era de esperar, los embriones con FQ fueron más susceptibles a las infecciones bacterianas y mostraron una mortalidad significativamente mayor en comparación con los embriones normales.

La terapia con fagos contra la infección por P. aeruginosa se administró tanto a los embriones de control como a los embriones con FQ, y el equipo observó una reducción significativa de la letalidad: una disminución promedio del 66% al 35% para los controles y del 83% al 52% para los embriones con FQ.

Cuando los investigadores probaron un tratamiento combinado de fagos con el antibiótico ciprofloxacino, observaron una tasa de mortalidad aún menor en comparación con los embriones tratados únicamente con fagos o con el antibiótico.

En general, los resultados mostraron que «la terapia con fagos puede reducir la letalidad, la carga bacteriana y la respuesta proinflamatoria causada por la infección de [Pseudomonas aeruginosa]», afirmaron los investigadores.

Los datos también sugirieron que «la terapia con fagos y la administración de antibióticos parecen ser un enfoque terapéutico prometedor, especialmente para reducir las dosis de antibióticos y la duración del tratamiento», concluyó el equipo.

Cafora M, Deflorian G, Forti F et al. Phage therapy against Pseudomonas aeruginosa infections in a cystic fibrosis zebrafish model // Scientific Reports 2019, 9, Article number: 1527. https://doi.org/10.1038/s41598-018-37636-x

Bacteriófago

Tratamiento exitoso de infección ósea resistente a antibióticos con fagos y antibióticos

Un paciente con una infección de la tibia izquierda causada por Acinetobacter baumannii XDR y Klebsiella pneumoniae MDR fue tratado con bacteriófagos y antibióticos.

Tras un breve período, se observó una mejora del tejido. Los patógenos pudieron ser lisados o eliminados mediante la terapia con fagos. De este modo, se logró salvar la pierna del paciente.

Nir-Paz R, Gelman D, Khouri A et al. Successful treatment of antibiotic resistant poly-microbial bone infection with bacteriophages and antibiotics combination // Clinical Infectious Diseases, Published: 14 March 2019, ciz222. https://doi.org/10.1093/cid/ciz222

Bacteriófagos del intestino humano

La flora intestinal humana está compuesta por una gran variedad de microorganismos diferentes. Mientras que los microorganismos bacterianos de la flora intestinal se han analizado bien, se sabe relativamente poco sobre la composición y la importancia fisiológica de las poblaciones de bacteriófagos asociados al intestino humano.

Se estima que en el intestino humano hay más de 1.000.000.000.000 de bacteriófagos. Estos contribuyen a mantener la compleja flora intestinal.

En este estudio, los autores resumen los métodos disponibles y los principales resultados sobre la composición, la estructura de la comunidad y la dinámica poblacional del fenómeno intestinal humano.

Shkoporov AN, Hill C. Bacteriófagos del intestino humano: Bacteriophages of the human gut: the “known unknown” of the microbiome 2019; 25(2):195-209. doi: 10.1016/j.chom.2019.01.017.

OMS: Limitar el uso de antibióticos para preservar su eficacia

Los antibióticos no pueden curar infecciones causadas por virus. Sin embargo, la temporada de gripe provoca cada año un aumento en el uso de antibióticos.

Durante los meses de invierno, diversos estudios han observado un incremento en la prescripción de antibióticos, especialmente en infecciones de las vías respiratorias superiores en niños de 0 a 3 años. Aunque los antibióticos pueden prevenir en algunos casos una infección bacteriana secundaria, son ineficaces contra los virus de la gripe.

Las encuestas han demostrado que el 64% de los encuestados creían erróneamente que los resfriados y la gripe podían tratarse con antibióticos. La mayoría de los casos de gripe se resuelven por sí solos, otros pueden tratarse con medicamentos antivirales.

Los antibióticos deben utilizarse con cuidado para conservar su eficacia cuando realmente se necesiten. Para orientar a los médicos sobre qué antibióticos deben emplearse en infecciones frecuentes y cuáles reservarse para las más graves, la OMS ha clasificado los antibióticos en tres categorías en su Lista Modelo de Medicamentos Esenciales: “Access”, “Watch” y “Reserve”.

La primera clase, denominada “Access” —es decir, acceso—, incluye aquellos antibióticos que deberían utilizarse preferentemente contra las enfermedades infecciosas habituales. Estos principios activos actúan de forma fiable y tienen pocos efectos secundarios, como por ejemplo la penicilina o la doxiciclina. Además, según el conocimiento actual, la probabilidad de que las bacterias desarrollen resistencias a estos medicamentos es baja.

En el segundo grupo, denominado “Watch” —es decir, vigilancia—, se enumeran antibióticos frente a los que ya existen las primeras resistencias. Solo deben utilizarse cuando los principios activos de la categoría Access no hayan funcionado o no puedan emplearse por otros motivos, por ejemplo, porque alguien sea alérgico a ellos. Con ello se pretende evitar que estos principios activos se vuelvan inútiles.

El último grupo —Reserve— contiene cuatro clases de principios activos antibióticos que o bien tienen efectos secundarios importantes o bien son completamente nuevos.

Seguridad y eficacia de un cóctel de bacteriófagos en un modelo in vivo de sinusitis

Los objetivos de este estudio fueron evaluar la seguridad y eficacia de un cóctel de fagos de Pseudomonas aeruginosa (PA) en un modelo ovino de rinosinusitis. El modelo de rinosinusitis ovina se adaptó para simular una infección por PA en los senos frontales de las ovejas. Para evaluar la eficacia, después de una fase de formación de biofilm de 7 días, las ovejas recibieron una irrigación con el cóctel de fagos o una solución salina dos veces al día durante una semana. La cuantificación del biofilm en la mucosa del seno frontal se realizó mediante tinción LIVE/DEAD BacLight.

Para evaluar la seguridad, un segundo grupo de control de ovejas recibió una irrigación con el cóctel de fagos dos veces al día durante 3 semanas. Se tomaron muestras de sangre y heces durante todo el tratamiento. Se tomaron muestras de tejido del seno frontal, pulmón, corazón, hígado, bazo y riñón, y se examinaron mediante microscopía electrónica de barrido (MEB).

Se observó una reducción significativa del biofilm en las ovejas tratadas con el cóctel de fagos. Los fagos aún pudieron detectarse en los senos frontales 16 horas después de la irrigación.

El segundo grupo de control de ovejas recibió una irrigación con el cóctel de fagos durante 3 semanas. Los fagos se detectaron de forma constante en las heces y esporádicamente en muestras de sangre y órganos. El examen de las muestras de tejido no reveló ningún daño tisular. En resumen, el cóctel de fagos fue capaz de reducir el biofilm en el seno frontal en 10^8-10^10 UFP/mL.

Fonga SA, Drillinga AJ, Ooia ML et al. Safety and efficacy of a bacteriophage cocktail in an in vivo model of Pseudomonas aeruginosa sinusitis // Translational Research, Disponible en línea el 19 de diciembre de 2018 https://doi.org/10.1016/j.trsl.2018.12.002