Bactériophages versus thérapie antibiotique sur les communautés bactériennes intestinales chez les tortues marines vertes
Les tortues marines vertes sont des herbivores en voie de disparition, des fermenteurs de l’intestin postérieur qui contribuent à une variété d’écosystèmes marins. Dans les hôpitaux pour tortues, les tortues affaiblies sont souvent réhabilitées. Le diagnostic précis d’une maladie étant difficile, les antibiotiques à large spectre sont systématiquement utilisés comme traitement général, ce qui peut endommager collatéralement le microbiote intestinal du patient. Nous avons évalué ici le concept d’application de bactériophages (phages) pour l’élimination de bactéries intestinales ciblées comme alternative à un antibiotique à large spectre (enrofloxacine) chez des tortues marines vertes cliniquement saines et maintenues en captivité. De plus, l’influence d’un antibiotique à large spectre (enrofloxacine) et d’une phagothérapie sur les communautés bactériennes intestinales des tortues marines vertes a été étudiée. Les communautés bactériennes intestinales dans les échantillons fécaux ont été analysées par séquençage des régions V1-V3 de l’ARNr 16S bactérien. Des cocktails de phages spécifiques aux bactéries (P <0,05) ont réduit de manière significative et ciblée Acinetobacter chez les tortues traitées par phages pendant la thérapie. Comparé au groupe témoin, aucune différence significative n’a été observée dans la diversité et la composition bactériennes chez les tortues traitées par phages. En revanche, la diversité bactérienne chez les tortues traitées par antibiotiques était significativement (P <0,05) réduite au 15e jour et tout au long de l’expérience. Le changement du microbiote bactérien des tortues traitées par antibiotiques était principalement dû à une augmentation de la fréquence des Firmicutes Gram-positifs et à une diminution simultanée des Bacteroidetes, des Protéobactéries et des Verrucomicrobia Gram-négatifs. De plus, nous avons observé que la fréquence relative de plusieurs bactéries à un niveau taxonomique inférieur était beaucoup moins affectée par les phages que par les antibiotiques. Ces données fournissent la preuve du concept de la phagothérapie pour la manipulation de la flore bactérienne transitoire ainsi que de la flore bactérienne indigène en cas de dysbiose intestinale chez les tortues.
Source :
Md. Shamim Ahasan, Robert Kinobe, Lisa Elliott, Leigh Owens, Jenni Scott, Jacqueline Picard, Roger Huerlimann, Ellen Ariel
Thérapie par bactériophages versus antibiotiques sur les communautés bactériennes intestinales de la tortue marine verte Chelonia mydas
Environmental Microbiology (2019), Première publication : 29 avril 2019,
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/1462-2920.14644
