Bacteriofagen versus antibioticatherapie bij darmbacteriegemeenschappen van groene zeeschildpadden
Groene zeeschildpadden zijn bedreigde herbivore achterdarmfermenteerders die bijdragen aan een verscheidenheid aan mariene ecosystemen. In schildpaddenziekenhuizen worden verzwakte schildpadden vaak gerehabiliteerd. Omdat een nauwkeurige diagnose van een ziekte moeilijk is, worden breedspectrumantibiotica routinematig als algemene behandeling gebruikt, wat mogelijk collaterale schade toebrengt aan het darmmicrobioom van de patiënt. Hier hebben we het concept geëvalueerd van het toepassen van bacteriofagen (fagen) om gerichte darmbacteriën te elimineren als alternatief voor een breedspectrumantibioticum (enrofloxacine) bij klinisch gezonde, in gevangenschap gehouden groene zeeschildpadden. Bovendien werd de invloed van een breedspectrumantibioticum (enrofloxacine) en faagtherapie op de darmbacteriegemeenschappen van groene zeeschildpadden onderzocht. Darmbacteriegemeenschappen in fecale monsters werden geanalyseerd door de V1-V3-regio’s van het bacteriële 16S rRNA te sequencen. Bacteriespecifieke faagcocktails (P <0,05) verminderden Acinetobacter significant en gericht in met fagen behandelde schildpadden tijdens de therapie. In vergelijking met de controle werd geen significant verschil in bacteriële diversiteit en samenstelling waargenomen bij met fagen behandelde schildpadden. Daarentegen was de bacteriële diversiteit bij met antibiotica behandelde schildpadden significant (P <0,05) verminderd op dag 15 en gedurende de hele proef. De verandering in de bacteriële microbiota van schildpadden die met antibiotica werden behandeld, was grotendeels te wijten aan een toename van de frequentie van grampositieve Firmicutes en een gelijktijdige afname van gramnegatieve Bacteroidetes, Proteobacteria en Verrucomicrobia. Bovendien observeerden we dat de relatieve frequentie van verschillende bacteriën op een lager taxonomisch niveau veel minder werd beïnvloed door fagen dan door antibiotica. Deze gegevens leveren het bewijs van het concept van faagtherapie voor de manipulatie van zowel de transiënte als de inheemse bacteriële flora bij darmgerelateerde dysbiose van schildpadden.
Bron:
Md. Shamim Ahasan, Robert Kinobe, Lisa Elliott, Leigh Owens, Jenni Scott, Jacqueline Picard, Roger Huerlimann, Ellen Ariel
Bacteriofaag- versus antibioticatherapie bij darmbacteriegemeenschappen van de groene zeeschildpad Chelonia mydas
Environmental Microbiology (2019), Eerste publicatie: 29 april 2019,
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/1462-2920.14644
