Batteriofagi versus terapia antibiotica sulle comunità batteriche intestinali nelle tartarughe verdi
Le tartarughe verdi sono animali erbivori a fermentazione intestinale posteriore in via di estinzione, che contribuiscono a una vasta gamma di ecosistemi marini. Negli ospedali per tartarughe, gli esemplari debilitati vengono spesso riabilitati. Poiché la diagnosi precisa di una malattia è difficile, gli antibiotici a largo spettro vengono utilizzati abitualmente come trattamento generale, danneggiando potenzialmente in modo collaterale il microbioma intestinale del paziente. Qui abbiamo valutato il concetto di applicazione dei batteriofagi (fagi) per eliminare batteri intestinali mirati come alternativa a un antibiotico a largo spettro (enrofloxacina) in tartarughe verdi clinicamente sane tenute in cattività. Inoltre, è stata studiata l’influenza di un antibiotico a largo spettro (enrofloxacina) e della fagoterapia sulle comunità batteriche intestinali delle tartarughe verdi. Le comunità batteriche nei campioni di feci sono state analizzate mediante sequenziamento delle regioni V1-V3 dell’rRNA 16S batterico. Cocktail di fagi specifici per i batteri (P <0,05) hanno ridotto significativamente in modo mirato l’Acinetobacter nelle tartarughe trattate con i fagi durante la terapia. Rispetto al controllo, non è stata riscontrata alcuna differenza significativa nella diversità e nella composizione batterica nelle tartarughe trattate con i fagi. Al contrario, la diversità batterica nelle tartarughe trattate con antibiotici è risultata significativamente ridotta (P <0,05) al 15° giorno e durante l’intero esperimento. Il cambiamento del microbiota batterico delle tartarughe trattate con antibiotici è stato in gran parte dovuto a un aumento dell’abbondanza di Firmicutes gram-positivi e a una contemporanea diminuzione di Bacteroidetes gram-negativi, Proteobacteria e Verrucomicrobia. Inoltre, abbiamo osservato che l’abbondanza relativa di diversi batteri a un livello tassonomico inferiore era molto meno influenzata dai fagi rispetto agli antibiotici. Questi dati forniscono la prova del concetto della fagoterapia per la manipolazione della flora batterica transitoria e autoctona nella disbiosi intestinale delle tartarughe.
Fonte:
Md. Shamim Ahasan, Robert Kinobe, Lisa Elliott, Leigh Owens, Jenni Scott, Jacqueline Picard, Roger Huerlimann, Ellen Ariel
Terapia con batteriofagi versus terapia antibiotica sulle comunità batteriche intestinali della tartaruga verde Chelonia mydas
Environmental Microbiology (2019), prima pubblicazione: 29 aprile 2019,
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/1462-2920.14644
